Debyer-原子模型分析和操作

Debyer简介 Debyer和其他程序用于分析和操作原子模型。特别地,Debyer可以用Debyer散射公式计算虚拟样品的粉末衍射图样。 Debyer将所有原子在虚拟样品中的位置作为一个输入文件(成 […]

Java CML过滤库(JCFL)

化学标记语言(CML)是用于存储和传输化学信息的XML应用程序。 CML的第一个正式发布是在1999年春天。不久之后,Egon Willighagen用Java编程语言编写了导入和导出过滤器。这些Ja […]

MayaChemTools-化学工具

MayaChemTools MayaChemTools是一个不断成长的Perl和Python脚本、模块和类的集合,以支持各种日常计算发现需求。 MayaChemTools官网下载 http://www […]

xeo纳米结构管理

什么是xeo xeo是一个免费的(GPLv3)Java开放项目,用于纳米结构管理。 特点 用于分子动力学,STM, kpoints,体模量,POV-Ray等的工具 GNU/Linux,微软,MacOs […]

EMBOSS-分子生物学软件

什么是EMBOSS EMBOSS即欧洲分子生物学开放软件套件(The European Molecular Biology Open Software Suite), 是一个免费的开源软件分析包,专门 […]

PROCHECK-蛋白质结构的立体化学性质检查

PROCHECK简介 PROCHECK检查蛋白质结构的立体化学性质,生成PostScript图,分析其总体结构和残留物的几何结构。包括检查核磁共振解决的结构质量的PROCHECK-NMR。 PROCH […]

LigBuilder-基于结构的药物设计多用途程序

LigBuilder简介 LigBuilder是一个多用途的基于结构的药物设计程序。基于目标蛋白的三维结构,在结合袋(binding pocket)内自动构建配体分子并进行筛选。 基于结构的药物设计的 […]

RnaViz-RNA分子二级结构图

什么是RnaViz RnaViz是一个用户友好的、轻量的GUI(图形用户界面)程序,用于生成发表质量的RNA分子二级结构图。 可以从包含结构信息的DCSE对齐文件或mfold ct文件开始创建图纸。结 […]

SCORE-估算已知三维结构的蛋白配体复合物经验方法

SCORE简介 基于结构的药物设计的一个中心问题是需要一种客观的方法来对候选化合物进行排序。SCORE是一种估计具有已知三维结构的蛋白配体复合物结合亲和力的经验方法。SCORE采用线性方程来描述结合过 […]

ASAD-大气化学

什么是ASAD ASAD是一个软件包,用于创建和集成大气模型中的化学方案,而不需要编写任何FORTRAN代码来解决化学速率方程。可用于广泛的问题,包括平流层化学、对流层化学或污染研究,并用于1D、2D […]

OSET-有机合成探索工具

什么是OSET OSET(Organic Synthesis Exploration Tool)是一个有机合成探索工具。 墨西哥国立自治大学化学学院的Ivan Tubert和Eduardo Tuber […]

OpenChrom-开源色谱、光谱和光谱学的软件

什么是OpenChrom OpenChrom®是一款用于色谱、光谱和光谱学的开源软件。不同系统的都数据可以导入和分析,因此它是一个独立于供应商的软件。 此外,它可以在Windows、macOS和Lin […]