VLinux-生物信息学Linux应用
什么是VLinux
VLinux是一个服务于学生和研究人员的生物信息学Linux发行版和应用。基于著名的openSUSE Linux发行版,使用Novell的Suse Studio构建。
VLinux官网下载
http://bioinformatics.org/vlinux/index.html

VLinux特点
- 完整的包,比如EMBOSS
- ClustalX等序列比对程序
- 带有网络界面 (wwwblast) 的独立NCBI BLAST安装
- BioPython, BioPerl和其他编程工具和库
- 版本控制系统
- 管理书目的工具
- PostgreSQL RDBMS
预先安装的生物信息学软件
- Boxshade
- ClustalW and ClustalX
- Dialign
- EMBOSS with emboss-explorer web-interface
- Genepop
- Mafft
- Muscle
- NCBI BLAST
- wwwblast
- Prank
- Probcons
- Biopython
- BioPerl
- Sequence Manipulation Suite 2
- Wise2
- Rasmol
- Gromacs
- Garlic
- Openbabel
- Chemtool
用python编程
- Python
- Biopython以及它所支持的第三方工具
- python-matplotlib
- IPython
- PyQt GUI(图形用户界面)编程
通用编程
- Git版本控制系统
- Gedit和Vim文本编辑器
- Meld差分/对比工具
- Qt设计器
- R
……更详细请查看VLinux官网

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