ImageJ Save As(保存为)

路径


描述

使用该子菜单将打开的TIFF、GIF、JPEG或者‘raw’格式的文件保存。也可以用来保存测量的结果、查找表、选区以及XY坐标。

Tiff…

将打开的图片或者堆栈保存为TIFF格式文件,与File ▷Save [s]命令重复。TIFF是支持所有ImageJ数据类型(8-bit、16-bit、32-bit浮点数以及RGB)的默认格式,也是能够保存空间和密度校准的唯一格式。此外选区和Overlays也以TIFF头信息保存。

默认情况下,16-bit和32-bit的图片以大端(big-endian)字节顺序保存。可在Edit▷Options▷Input/Output…对话框中选中Save TIFF and Raw in Intel Byte Order选项,将文件以小端(little-endian)字节顺序保存文件。

Gif…

将打开的图片保存为GIF格式。RGB图片必须先使用Image▷8-bit Color命令将图片转化为8-bit的颜色。透明指数的值(0-255)可以在Edit▷Options▷Input/Output…对话框中设置。堆栈会保存为动态GIFs。并通过Image▷Stacks▷Tools▷Animation Options…[Alt/](或者右键堆栈幻灯片前的播放/暂停键)来设置帧率。

JPEG

将打开的图片保存为JPEG格式。编辑JPEG的质量:Edit▷Options▷Input/Output…对话框来确定JPEG的压缩率(0-100)。该值会显示在保存对话框中。值越小图片越小,图片的质量也越低。相反,设置的值越大,图片文件就越大,但是质量也就越高。当值设定为100时,颜色采样(Color sub-sampling)功能会被取消,以减少人工对颜色的影响。

Text Image…

将打开的图片保存为与电子表格兼容的制表符分割的文本文件。校准的以及浮点数图片列在Analyze▷Set Measurements…中,其精度由Decimal places确定。对于RGB图片来说,每个像素都会使用公式gray=(red+green+blue)/3转化为灰度图,而如果选项Weighted RGB to Grayscale Conversion被选中的话,会使用Edit▷Options▷Conversions中的公式gray=0.299×red+0.587×green+0.114×blue来转化。

Zip…


将打开的图片保存为堆栈或者TIFF文件存储在一个压缩的ZIP文档中。

ImageJ Text Images对话框
Text Images: File▷Import▷Text Image…以及File▷Save As▷Text Image…

Raw Data…

将打开的图片保存为不带头信息的raw像素数据。8-bit图片保存为不带符号的字节,不带符号的16-bit图片保存为不带符号的shorts(缩写?),带符号的16-bit图片保存为作为浮点数的形式保存,而RGB以三个字节一个像素的形式保存。16-bit和32-bit(float)的图片以大端字节顺数法保存,除非Edit▷Options▷Input/Ouput…对话框中的Export▷Raw in Intel Byte Order选项被选中。

Image Sequence

将堆栈和多维堆栈保存为一个图片序列。

选项 描述
Format  设定图片输出格式,可以使BMP、FITS、GIF、JPEG、PGM、PNG、Raw、Text Image、TIFF或者Zip(参考图片类型和格式)。在IJ1.44及之后版本找那个,Overlays也会在保存为JPEG和PNG格式时嵌入其中。
Name  设定数字文件名的公共签到字符串。
Start At  (仅堆栈)设定序列中的起始编号。
Digits (1-8)  递增序列的号码数字。文件名前导由0填充。
Use slice labels as filenames  (仅堆栈)如果选中的话,没一片都会以带有其标签的形式保存(显示在图片上方的图片子标题)并且数字顺数不起作用。

多维堆栈,图片以‘Name_t d_z d_c d’的形式保存,其中d是指定数值的增量。t画面;z为片数,c为频道。比如上图快照中的描述,图片将会保存为‘mitosis_t001_z001_c001.tif’。


PNG…

将打开的图片保存为PNG格式(便携式网络图片格式)。除RGB格式外的所有图片格式都保存为8-bit的PNG。16-bit图片保存为16-bit的PNGs。对8-bit图片来说,透明度指数(0-255,没有为-1)可以在Edit▷Options▷Input/Output…对话框中进行设置。Overlays会在保存为PNG时嵌入其中。

FITS…

将图片保存为FITS格式(弹性图像传输系统)。

LUT…

将打开图片的查找变保存到一个文件。768字节的文件由256红色、256绿色以及256蓝色组成。

Results

将结果窗口中的内容导出为一个制表符分割或者逗号分割(.csv)的文本文件。在1.44b版本之前,该命令被命名为“Measurements…”

Selection

将目前的区域选择边界保存到一个文件中,该文件可以在之后使用File▷Open…[o]来恢复并且打开选区。激活的选区和Overlay以TIFF头信息默认保存。

XY coorinates…

将ROI(兴趣区)的XY坐标导出为两列制表符分割的文本文件。ROI的坐标也可以通过Edit▷Selection▷Properties…[y]中的List coordinates选项进行检索,该ROI坐标的表格以一个像素间隔均匀分布。







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