ImageJ使用手册翻译 part47 File命令第二部分

avatar 2019-07-2017:25:38 评论 164

File命令第二部分

26.6.3 LUT

打开ImageJ或者NIH图片查找表,或者raw查找表。Raw的LUT文件必须768字节长并且包含256红色、256蓝色和256绿色。如果没有图片打开,会创建一个256×32的ramp图片来显示LUT。注意具有.lut扩展名的查找表也可以用File▷Open…[o]或者拖放的方式打开。

 

26.6.4 Text Image…

将制表符分割的文本文件打开为32-bit的实时图像(参考Text Images)。图片宽度和高度由对文件中的字数和行数的扫描确定。对于整数值不大于255的文本文件,利用Image▷Type▷8-bit来转化为8-bit图片。在转化之前,将Edit▷Options▷Conversion…中的Scale When Converting选项去掉,以防止图片被扩展为0-255。

 

26.6.5 Text File…

打开一个文本文件。注意文本文件也可以通过File▷Open…[o]或者直接拖放的方式打开。

 

26.6.6 URL…

 

下载并显示URL指定的已知格式到ImageJ。其他的以‘/’和‘.html’结尾的URL会用用户默认的浏览器打开。输入的URL会保存在ImageJ的preferences file里,并会在IJ重启时恢复。

也可以使用URL打开包含多个DICOM图片的zip文档。一些示例的URL:

http://imagej.nih.gov/ij/images/ct.dcm

– file:///Macintosh HD/images/Nanoprobes.tif

– file:///D:images\neuron.tif

http://imagej.nih.gov/ij/ (打开ImageJ网站)

 

26.6.7 Results

打开ImageJ表格,或者任意制表符分隔的或者逗号分隔的文本文件(参考结果表)。注意.csv和.xls文件也可以通过拖放的方式打开。

 

26.6.8 Stack From List…

从一个包含一系列图片文件路径的文本文件或者URL打开一个堆栈,或者虚拟堆栈。图片可以来自不同文件夹,但是它们必须是相同的尺寸和类型。Virtual Stack From List宏说明了如何生成一个图片的列表并用该列表来将这一系列的图片打开为虚拟堆栈。而OpenStackUsingURLs宏则演示了如何从远程服务器打开一个图片序列。

 

26.6.9 TIFF Virtual Stack…

将TIFF文件打开为虚拟堆栈(参考虚拟堆栈和III通过拖放打开虚拟堆栈)

26.6.10 AVI…

使用一个内置的AVI文件读取插件将AVI文件(JPEG或者PNG压缩或未压缩文件)打开为一个虚拟堆栈(一片为一视频帧)。动画速度是从图片帧率中检索出来的。AVI文件也可以通过File▷Open…[o]或者拖放的形式代开,但是用宏的话就必须使用该命令去访问对话框中的选项。

ImageJ只支持有限数量的AVI格式,包括MJPEG(动态JPEG)和YUV 4:2:2/4:2:0压缩格式(参考插件源代码)。OME Bio-Formats library(参考非本地格式)能够扩展支持MSRLE和MSV1编码格式。

AVI读取器对话框

AVI读取器对话框

对话框的辅助可允许你选择是否要将帧转化为8-bit的灰度图或者垂直地翻动。对于大大文件来说,也有一个选项可以将视屏打开为虚拟堆栈(参考虚拟堆栈)。可以指定起始和结束的帧。输入0指定最后一帧,-1指定倒数第二帧。

 

26.6.11 XY coordinates…

将比如由File▷Save As▷XY Coordinates…生成的两列数据的文本文件打开为一个多边形选区。该选区将会显示在当前的图片中,而如果图片太小的话,选区将会显示在一个新的空白图片中。激活的选区的坐标(以一个像素间隔均匀分布)可以通过Edit▷Selection▷Properties…[y]中的List coordinate选项来进行检索。

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