ImageJ Image Sequence(图像序列)

路径


描述

将选中文件夹中的一系列图片打开为一个堆栈。图片可能有不同的大小,也可以是ImageJ支持的不同类型(参考图片类型和格式以及处理额外文件类型插件)非图片文件(脚本,.lut、.roi、RoiSet.zip等)会被忽略。

ImageJ Sequence Options对话框
所创建的堆栈的宽度×高度×深度的信息显示在对话框的底部。
选项描述
Number of images(图片数量) 确认打开几张图片
Starting Image 如果设置为n,导入将从第n张图开始
Increment如果设置为 “2” 每隔一张图片会被打开,而设置为“3”时每第三张图片会被打开,以此类推。
File Name Contains 输入一个字符串,ImageJ将只打开文件名中包含该字符串的文件。
Enter Pattern 高级搜索过滤的正则表达式可以写在这里。
Scale Images将值设置为小于100%可以减少内存(占用)。比如设置为50%可以将打开一个堆栈所需的内存降低25%(二维图片:原始数据的0.5×0.5=0.25)。但如果Use Virtual Stack复选框选中的话,该设置就无效了。
Convert to RGB 可允许打开混合的RGB图片的和灰度图片,但将所有图片都转化为了RGB图片。
但是要注意,如果该选项未选中,并且第一张导入的图片是8-bit的话所有后续导入的图片都会被转化为8-bit格式。将该选项选中,绕过该问题。
Sort Names Numerically选中的话,以文件名的数字顺序打开堆栈(比如:name1.tif,name2.tif,name10.tif)而不是以字母数字的顺序(比如:name1.tif,name10.tif,name2.tif)。
同一系列文件中的DICOM文件(tah#0020,0011)总是以图片的序号来分类(tag#0020,013)。ListDicom Tags宏集中的List Stack Tags宏可以列出图片序号的值以及图片序列的标签。
Use Virtual Stack当选中时,图片将被打开为只读模式的虚拟堆栈,用于打开的插件为Virtual Stack Opener。这样做对于打开那些对于运行内存(RAM)来说太大的图片序列十分有用,但是访问的速度会很慢,并且当切换到另一张图片时所作的改变将会丢失(参考虚拟堆栈)。要启用该选项要注意一下几点:

-图片Overlay未被加载

-如果文件夹包含tiff堆栈,只导入堆栈的第一片(内存驻留堆栈中的所有片都会被导入并串联为一个序列)(参考Image▷Stacks▷Tools▷Concatenate…)。

Help 打开网址http://imagej.nih.gov/ij/docs/menus/file.html#seq1

正则表达式基本语法总结。更过正则表达过滤参考http:

//download.oracle.com/javase/tutorial/essential/regex/.

正则表达式(字符类)举例含义描述
[]分割要匹配的字符集[aA]大写或者小写字母A
字符范围[0-9]任意数字(0-9)
.任意字符[0-9].任意数字加其他字符
*前项之前0或多个.*任意字符顺序
?前项之前零0或1个[0-9]?一个可选数字
+前项之前1个或多个[0-9]+至少一个数字
^否定[^0-9]任意不是数字的字符
&&AND(交集)[0-9&&[^3]]不是3的一个数字
|OR(或)[0-9][a-Za-Z]一个数字或者一个大写/小写字母






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