ImageJ ROI Manager(兴趣区管理器)

路径


描述

ROI Manager-兴趣区管理器是一个用于处理多个选区的工具。选区可以来自图像上的不同位置、堆栈的不同切片或来自不同的图像。支持所有选区类型,包括点、线和文本。

ROI Manager-兴趣区管理器

选项

选项 描述
Add

将当前选区添加到列表。ROI Manager创建三个部分的标签。

第一部分为(仅堆栈)切片数;

第二部分为选区的Y坐标;

第三部分为X坐标。单击标签将关联的选区恢复到当前图像。对于堆栈,选区被恢复到它来自的切片。

Update 用当前选区替换列表中选择的ROI,在Stacks and Hyperstacks中更新z/t位置。
Delete 从列表中删除选中的ROI。如果没有选择,则删除所有ROI。
Rename 重命名所选的ROI。
Measure 测量选中的ROI,如果没有选,则测量列表中的所有ROI。测量的参数通过Analyze▷Set Measurements来指定。
Deselect 取消选中列表中的ROI。
Properties 打开一个对话框,在该对话框中可以指定一定宽度的轮廓颜色(描边颜色)或填充颜色。将Stroke Width设置为0,则不管图像的缩放而绘制选区的宽度为1像素。
Flatten 等同于Image▷Overlay▷Flatten。
ShowAll 切换所有ROI Manager Overlays的显示。
Labels 切换由Show All显示的标签。
More(点击查看) 显示带有几个附加命令的下拉菜单,这些命令也可以通过右键ROI Manager的列表执行。
XOR 在选定的roi上创建复合选区。如果没有选择ROI,则应用到所有ROI。
Split 将当前选区(必须是复合选区)分割为多个组成部分,并将其添加到ROI Manager中。
Add Particles 将颗粒分析器分割的对象添加到ROI管理器中。要求勾选Analyze▷Analyze Particels中的Record Starts选项。
Multi Measure 测量堆栈中所有片上的所有ROI,创建一个结果表,每个片有一行(如果勾选了One Row Per Slice),或者每个测量一行
Multi Plot 对单个图上选定的ROI执行Analyze▷Plot Profile。如果没有选择,所有选区都被绘制出来。
Sort 按字母数字顺序对列表进行排序。
Specify 等同于Edit▷Selection▷Specify。提示允许在指定的位置创建ROI。
Labels 等同于Image▷Overlay▷Labels,允许在Show All勾选时时定制选区的标签
List 打印一个表,详细说明存储在管理器中的ROI的属性,包括:index(索引)、Name(名字)、XY coordinates of ROI(ROI中心的XY像素坐标)
Options

显示一个对话框允许设置几个ROI Manager选项:

Associate “Show All” ROIs with slices:如果勾选此项,Show All只会在浏览各自的切片时显示ROI,如果未选中此选项,roi将显示在所有堆栈片中;

Restore ROIs centered:勾选此项,则同通过More>>Open打开的ORI在画布中居中显示。此选项可避免在图像调整大小时,将已加载的ROI显示在边界之外。

Use ROI names as labels 如果勾选此项,当“在标签”复选框处于活动状态时,ROI名称将用作选择标签。如果未选中此选项,则使用Manager列表中的ROI位置。重命名可以通过Rename或Properties实现。





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