ImageJ Subtract Background(扣除背景)


路径


描述

从gels和其他图像中移除平滑连续的背景。基于Sternberg Stanley所描述的“滚动球”算法的概念,生物医学图像处理。假设二维灰度图像在图像中的每一点都有一个三维(高度),创建一个表面。一个给定半径的球滚过这个表面的底部;球所能到达的体积的外壳就是要减去的背景。

该命令使用“滑动抛物面”或“滚动球”算法,用来纠正不均匀的照明背景
Process ▷ Subtract Background 该命令使用“滑动抛物面”或“滚动球”算法,可以用来纠正不均匀的照明背景,如图每个图像下面所示(Analyze ▷ Plot Profile )。滚动球的半径至少应该设置为不属于背景的最大对象的大小。

Rolling Ball Radius

抛物面的曲率半径。作为一个经验法则,对于8-bit或RGB图像,它应该至少和图像中最大的不属于背景的物体的半径一样大。

较大的值也可以,除非图像的背景太不均匀。对于像素值范围在0-255之间的16-bit和32-bit图像,半径应与像素值范围成反比(例如,为16-bit图像(像素值0-65535),典型的半径值在0.2到5之间)。


Light Background

处理具有明亮的背景和黑暗的对象的图像 。


Separate Colors

(仅RGB图像)如果未选中,操作将只影响亮度,留下色相和饱和度不变。


Create Background (Don’t Subtract)

如果勾选此项,输出的不是减去背景的图像,而是背景本身。这个选项对于检查创建的背景非常有用(结合Preview选项一起)。Create Background也可以用于自定义背景减法算法,在创建背景之前,图像被复制和过滤(例如去除背景中的’ 洞 ‘),最后用Process▷Image Calculator减去它。


Sliding Paraboloid

如果勾选此项,“滚动球”被一个抛物面取代,它在顶点有相同的曲率,作为一个球的半径。这个选项允许半径> 0.0001的任意值(“滚动球”算法要求半径至少为1)。“滑动抛物面”通常产生更可靠的校正,因为“滚动球”,一个遗留算法(仅保留向后兼容性),容易产生边缘’人为副产品’。

为了减少计算时间,“滚动球”算法以不一致的方式降低图像。“滑动抛物面”算法不使用降尺度,因此不会产生降尺度副产物。然而,“滑动抛物面”也是一种近似值,因为它并不使用事实上的抛物面(确切的实现需要很大的计算努力),而是在图像上沿不同方向滑动抛物线。


Disable Smoothing

为了计算背景(“滚动球”),图像被最大化过滤 (3×3像素)去除异常点,如灰尘,然后平滑以减少噪音平均超过(3×3像素)。勾选Disable Smoothing,未修改的图像数据用于创建背景选中此选项以确保减法后的图像数据永远不会位于背景之下。




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