ImageJ Batch(批处理)

路径


描述

此子菜单允许在一系列图像中执行命令,而无需人工干预。

Batch命令是非递归的,也就是说,这些命令会应用到所选文件夹中的所有图像,但是不包括其子文件夹中的文件。不过,可以使用ImageJ宏语言对目录层次结构进行转换。

在执行批处理操作修改已处理图像时,要记住三个关键方面:

  • 文件容易被覆盖,因为批处理程序会悄无声息地覆盖具有相同名称的现有文件。
  • 目标输出文件夹应该有足够的磁盘空间来接收创建的图像。
  • 对于非本机格式,批处理操作将受到reader插件或库行为的影响。

子命令

子命令 描述
Measure

此命令测量用户指定文件夹中的所有图像。

原理是对所选文件夹中所有图像应用Analyze▷Measure命令。

注意,测量是在非阈值图像上进行的。对于主动选择保存为TIFF的图像,测量的是ROI而不是整个图像。

Convert 成批转换和/或调整(大小)一个指定的文件夹中的多个图像。
Macro 对指定的文件夹运行宏。
Virtual Stack.

该命令与Batch▷Macro共享接口。

允许虚拟堆栈操作。例如,裁剪虚拟堆栈可以执行以下步骤:

  • 1.打开虚拟堆栈;
  • 2.运行Process . Batch . Virtual Stack;
  • 3.选择一个输出文件夹和输出格式;
  • 4.从“Add Macro Code”下拉菜单中选择“Crop”选项;
  • 5.根据需要编辑宏代码,并按下Test按钮来测试宏;
  • 6.单击Process创建裁剪的虚拟堆栈。注意,裁剪的图像不会加载到内存中,而是在裁剪时保存到磁盘中。
Image Calculator

图像计算器。

在从弹出菜单中选择的两个图像之间执行算术和逻辑操作。

Subtract Background 从gels和其他图像中移除平滑连续的背景。





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