ImageJ使用手册翻译part17-3D Volumes

avatar 2019-06-2015:00:20 评论 147

目前,ImageJ对3D兴趣区(包含成群连续的体素的选区)的支持还有限。但是在这种限制在ImagJ2和ImageJ1的一些插件中有所改善。下面所列的是一些在处理多维物体时十分有用的插件。注意,要手动地将这些插件作为独立的ImageJ插件来安装是十分困难的,因为它们都绑定在Fiji上。

 

3D Filters (过滤器)  通过Process▷Filters▷Gaussian Blur 3D…来安装专业的3D过滤器以便进行3D操作

 

3D Object Counter(对象计数器)3D Object Counter (3D-OC)可以对3D物体在堆栈中进行计数和量化 ,类似于2D分析中的Analyze▷Analyze Particles…操作。而3D Roi Manager是对3D Object Counter的补充,作为一个伴随插件为ImageJ增加3D ROI Manager(兴趣区管理)功能。

 

3D Viewer(查看器) 3D Viewer为ImageJ带来了硬件增强的3D视觉,扩展了ImageJ▷Stacks▷3D Project…中有限的功能。在ImageJ3D Viewer中堆栈被显示为以结构为基础的透视体、表面或正交的片。它是宏可记录的并且可以作为高级编程库而为其他3D视觉的插件使用。

Simple Neurite Tracer(简单神经突追踪) 简单神经突追踪可实现管状结构的半自动分割。

 

TrackEM2 如之前所提一样,TrackEM2以其针对多维兴趣区的强大的工具为特征。

ImageJ中文教程

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