ImageJ使用手册翻译 part15-11 Overlays

avatar 2019-06-1615:00:19 评论 156

Overlays

Overlays 是未激活的选区,其显示在像素数据之上,即图片上的覆盖层,是ImageJ无损处理图片的核心。在某种程度上你可以认为Overlay是不可见的兴趣区管理器,在其中可以添加兴趣区,并让兴趣区处于“待命”的状态。该多个选区的概念在ImageJ2中极大地提高了,因此如果多选区在你的工作中很重,我们建议你赶紧下载IJ2。

使用ImageJ的overlay对图片进行无损处理。Overlays可用于对图片进行标注、存储具有不同透明度的过个兴趣区以及混合的图片(ImageJROIs)。关于Image▷Overlay▷的更多例子和说明,你可以下载最新的ImageJ版本来练习overlay编辑(图片来自ImageJ User Guide)

 

重要的是,覆盖选区(overlay selections)是矢量图形,即由数学定义的轨迹(有别于光栅图形,光栅图形中的物质由像素定义),因此不会受到放大和缩小的影响,比如,不会变得像素化(想象一下马赛克)。大多数与overlay有关的命令都列在Image▷Overlay▷和ROI管理窗口(Analyzer▷Tool▷ROI Manager…)下。覆盖选区的外形可以通过Image▷Overlay▷overlay Options…/labels来调整。

正如在Ⅱ图片类型:有损压缩和元数据中所提的一样,overlays会保存为tif格式的图片,并且在使用TIFF这种ImageJ默认的文件格式时不用进行额外的保存。 Overlays的主要优点列在下面:

兴趣区(ROIs)存储: 在ImageJ中一次只能有一个兴趣区。然而,在Overlay中,是可以通过B键(Image▷Overlay ▷Add Selection…[b])添加多         个选区的。兴趣区一旦添加到图片的overlay,就可以通过Alt-单击、Control-单击或者长按(1/4秒或者更长)来激活。也可以使用                             Image▷Overlay▷From ROI Manager/ To ROI Manager命令成批添加或者恢复选区。

添加无损注释:在ImageJ中使用overlays来添加注释是最好不过的方式。作为矢量图形,overlays不会改变像素值,即使在很大的放大倍数之下也可           以任意放大缩小而不会丢失质量,而且可以显示不同的透明度值。使用Shift+F(即Image▷Overlay▷Flatten [F]的快捷键)可以对图片建立带有         内嵌overlay的快照。也可以将图片保存为PNG或者JPEG(File▷Save As▷)或者打印图像画板的方式创建“Flattened(平滑化?)”的图片。         Flatten命令在ROI管理器中也可以找到。

ImageJ ROIs(兴趣区) ImageJROI就是以覆盖/叠加的方式展示图片中感兴趣(有研究价值)的区域。正如Edit▷Selection▷Image to Selection…         以及Image▷Overlay▷Add Image…所描述的一样,可允许多个图片混合在一个画布上。

ImageJ的3D视图

3D Viewer (Fiji1.46o),为ImageJ带来3D视觉的硬件强化。就如在3D Volumes中所说明的一样,大多数真正拓展了ImageJ多维数据功能的插件都绑定在Fiji上了。 (图片来自ImageJ User Guide)

ImageJ中文教程

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