ImageJ使用手册翻译part14-10 选区

avatar 2019-06-1415:00:31 评论 217

选区

 

选区(感兴趣的区域,ROIs),通常由工具栏工具创建。虽然ImageJ可以同时展示几个“兴趣区”,但是一次只能激活其中的一个。在选择区域的情况下,被选择区可以测量(Analyze▷Measure…[m]),绘图(Edit▷Draw[d]),充填(Edit▷Fill)或者过滤(Process▷Filters▷次级菜单)。此外,也可以实现多个兴趣区的无损叠加。

 

选区最开始由ImageJ中的九种默认颜色(红、绿、蓝、洋红、蓝绿、黄、黑和白)之一勾勒出来。一旦建立之后,选区可以用Edit▷Selection▷Properties…[y]中其他任何颜色勾勒或着色。选取的颜色可以通过Edit▷Options▷Colors…、双击Point Tool或者使用快捷键(参考第七部分,使用键盘快捷键修改选取的颜色)等方式来修改。它在Point Tool和Multi-point Tool的中心是突出显示的。

ImageJ中的三种选区:注意光标的变化:在选区中为箭头,在选区外为十字,在选区顶点(或者叫handler)则变为手型。注意在多边形选区中带充填的handler,以及复合选区中不具有handler。叠加,比如说在无损图片叠层中展示未激活的选区也不具有handlers.(图片来源于ImageJ User Guide, 仅用于解说)

 

 

操作/处理兴趣区

 

大多数在定义或者勾画选取的过程中有用的命令都在Edit▷Selection▷次级菜单中可以找到,并且总结在了兴趣区操作部分了。下面所列的是选取操作中最常用的命令。

 

 

调整(Adjusting) 选取的调整可以用Brush Selection Tool来实现。此外,由Polygon Selection Tool和Segmented Line Selection Tool创建的选区的顶点,可以使用Alt+Shift-单击的方式来调整。

删除(Deleting)挑任何一个选择工具然后单击选区的外部,或者使用Edit▷Selection None [A]。使用Edit▷Selection▷Restore Selection来恢复被删除的选区. 有叠加的情况下,激活的兴趣区可以使用Backspace键(苹果电脑是Delete键)来删除。

管理(Managing)一个选区可以从一个图片窗口传递到另一个窗口,只要激活目的窗口然后运行Edit▷Selection▷Restore Selection [E]。另一种方法是,通过Analyze▷Tool▷Synchronize Windows来创建跨图片的兴趣区。多图选区可以保存为Overlays(叠加)或者保存在兴趣区管理列表中(Analyze▷Tools▷ROI Manager…)。

移动(Moving) 选区的移动可以通过单击和拖动来实现,前提是(鼠标)光标在选区内并且变成了箭头形状。状态栏会显示选区左上角的坐标(对非矩形选区来说显示其举行边界的坐标)。如果是要移动选区内的内容而不是选区本身,那么使用Edit▷Copy [c],Edit▷Paste [v],然后在选区被单击然后拖动。

微调(Nudging)使用键盘的方向键可以对选区在任意方向进行微调,一次移动一个像素。注意在没有选区的情况下上下键是对图片进行放大和缩小。

调节尺寸(Resizing)Brush Selection Tool可以用来调整兴趣区的轮廓。大多数的兴趣区都可以使用Alt+上、下键的方式来进行大小的调节,一次改变一个像素。总而言之(更多细节参考Area Selection Tool和Line Selection Tool),改变选区的大小可以通过拖动选择工具之一来实现。在拖动时,按住Ctrl键时围绕选区的中心调整其大小、按住Alt键时,固定(图片)长宽比(等比缩放)、而按住Shift键则规定1:1的长宽比。

 

复合选区

(图片来源于ImageJ User Guide, 仅用于解说)

复合选区是一系列不连续的兴趣区,亦即多个兴趣区包含的像素群/或者兴趣区内包含空洞。复合兴趣区通常是由Brush Selection Tool创建的,但是使用修改键的话也可以用其他的选择工具来定义。

 

下面的修改件可用于创建复合选区:

Shift 按住Shift键在已有选区外部画选区。如果增减矩形或椭圆选区,要在增加选区后释放Shift键。

Alt 按住Alt键在已有的兴趣区内画选区,从而可以将原兴趣区中的一部分内容移除(变成了空洞)。

注意有一些操作在复合兴趣区中是执行不了的。在这些情况下,将一个复合选区利用Edit▷Selection▷Enlarge…命令将兴趣区转化为多边形选区可能会有所帮助。

 

亚像素坐标选区

从ImageJ1.46开始,可以在亚像素精度上进行选区,超出了名义上图片的像素分辨率:Floating point selections。在Sub-pixel resolution复选框选中(Edit▷Options▷Profile Plot Options…)的前提下,可以在浮点坐标上创建线性选区。利用Edit▷Selection▷Interpolate命令对原有选区的亚像素坐标进行修改。

修改选区:具有亚像素精度(左)和没有亚像素精度(中)的选区。线条选区可以在Edit▷Options▷Profile Plot Options…下激活Sub-pixel resolution复选框来使用。区域选区的像素坐标可以通过Edit▷Selection▷Interpolate来修改。右图是由SubpixelSelections.js生成的,SubpixelSelections.js是一个脚本,其可以实现不设置ImageJ中的任何选项来创建亚像素选区(图片来源于ImageJ User Guide, 仅用于解说)。

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