PubMed Central-公共医学中心

什么是PubMed Central (PMC)?

PubMed Central (PMC)是一个免费的数字存储库,可以将发表在生物医学和生命科学期刊文献上的全文学术文章存档。作为国家生物技术信息中心(NCBI)开发的资源套件中的主要研究数据库之一,PubMed中心不仅仅是一个文档存储库。提交到PMC要经过一个索引和格式化过程,这将产生增强的元数据、医学本体和惟一标识符,所有这些都丰富了存放的每篇文章的XML结构化数据。PMC中的内容可以很容易地链接到许多其他NCBI数据库,并通过Entrez搜索和检索系统进行访问,从而进一步增强公众自由发现、阅读和构建生物医学知识组合的能力。

PubMed Central

PubMed Central和PubMed非常不同。PubMed Central是一个免费的完整文章的数字存档,任何人都可以通过web浏览器从任何地方访问它(具有不同的重用条款)。相反,尽管PubMed是一个可搜索的生物医学引文和摘要数据库,但全文实际上却在别处(以印刷或在线、免费或付费的形式)。

截至2018年12月,PMC档案包含超过520万篇文章,其中的贡献直接来自出版商或作者,根据美国国立卫生研究院的公共获取政策,他们将自己的手稿存入存储库。较早的数据显示,从2013年1月到2014年1月,作者发起的存储在这12个月期间超过了103,000篇论文。PMC还确定了大约4000种期刊,它们现在参与到自动将其发表的内容存入PMC存储库的某些能力中。一些参与的出版商将他们的文章在PubMed中心发布后的一段时间内推迟发布,这通常被称为“封锁期”,根据期刊的不同,这段时间可以从几个月到几年不等。(最常见的是6至12个月的禁止。)然而,PubMed Central是“由第三方进行系统的外部分发”的一个关键例子,这仍然被许多出版商的投稿协议所禁止。

采纳

成立于2000年2月,库中快速增长的NIH公共访问政策旨在让所有美国国立卫生研究院(NIH)的任何人自由访问,此外,许多出版商正在与美国国立卫生研究院合作,提供免费使用他们的作品。2007年底,《2008年综合拨款法案》(H.R. 2764)被签署成为法律,其中包括一项条款,要求NIH修改其政策,并要求将其同行评审的研究和NIH资助的研究结果的完整电子副本纳入PubMed Central。这些文章必须在12个月内发表。这是美国政府第一次要求一个机构提供研究的开放获取,是2005年政策的演变,当时NIH要求研究人员自愿将他们的研究添加到PubMed中心。

英国版的PubMed中央系统(UK PubMed Central, UKPMC)是由维康信托基金会(Wellcome Trust)和大英图书馆(British Library)共同开发的,是英国9大科研资助者之一。该系统于2007年1月上线。2012年11月1日,它成为欧洲公共医疗中心。PubMed中心国际网络的加拿大成员PubMed中心加拿大于2009年10月成立。

国家医学图书馆《NLM期刊出版标签集》期刊文章标记语言免费提供。[9]学术和专业协会出版商协会评论说:“它很可能成为为书籍和期刊准备学术内容的标准。”书籍有一个相关的DTD[10]。[11]美国国会图书馆和英国图书馆已经宣布支持NLM DTD。它也受到期刊服务提供商的欢迎。

随着美国国家卫生研究院以外的许多机构发布了公共访问计划,PMC正在成为更广泛的各种文章的存储库。这包括NASA的内容,接口被标记为“Pubspace”。

技术

通过使用各种文章dtd,发布者通过XML或SGML将文章发送到PubMed Central。较老的和较大的出版商可能有自己的内部DTD,但是许多出版商使用NLM Journal Publishing DTD(见上文)。

接收到的文章通过XSLT转换为非常类似的NLM归档和交换DTD。此过程可能会显示错误,并将其报告给发布服务器进行更正。图形也被转换成标准格式和大小。原始和转换后的表单被存档。转换后的表单将与用于图形、多媒体或其他相关数据的关联文件一起移动到关系数据库中。许多出版商也提供他们的文章的PDF,这些都是免费的。

书目引用被解析并自动链接到PubMed中的相关摘要、PubMed中心的文章和出版商网站上的资源。PubMed链接也通往PubMed中心。无法解析的引用,例如在这些来源中尚未提供的期刊或特定文章,将在数据库中进行跟踪,并在资源可用时自动“激活”。

内部索引系统提供了搜索功能,并了解生物学和医学术语,如通用和专有药物名称,以及生物体、疾病和解剖部分的替代名称。

当用户访问期刊时,通过检索该期刊的所有文章、信件、社论等,会自动生成一个目录表。当到达实际的项目(如文章)时,PubMed Central将NLM标记转换为HTML交付,并提供到相关数据对象的链接。这是可行的,因为传入的各种数据首先被转换为标准dtd和图形格式。

在单独的提交流中,NIH资助的作者可以使用NIH手稿提交(NIHMS)将文章存入PubMed中心。因此,提交的文章通常通过XML标记转换为NLM DTD。

接受

在学术出版界,对PubMed Central的反应,有的人表现出真正的热情,有的人则表现出谨慎的关注。

虽然PMC是欢迎合作伙伴开放获取出版商在增加生物医学的发现和传播知识的能力,同样的事实导致其他人担心交通从发表version-of-record被转移,减少读者的经济后果,以及影响维护一个社会学者在学术团体。2013年的一项分析发现,强有力的证据表明,公共发表文章资料库是“吸引大量读者远离期刊网站”的原因,而且“PMC的影响正在随着时间的推移而增长”。

图书馆、大学、开放获取支持者、消费者健康倡导团体和患者权利组织都对PubMed Central表示赞赏,并希望看到其他联邦资助机构开发的类似的公共获取资料库,以便自由共享任何由纳税人资助的研究出版物。

Antelman关于开放获取出版的研究发现,在哲学、政治科学、电子电气工程和数学领域,开放获取论文具有更大的研究影响力。一项随机试验发现,开放获取论文的内容下载量有所增加,但在发表一年后,其被引用的次数没有订阅次数多。

美国国立卫生研究院的政策和开放获取知识库的工作启发了2013年的一项总统指令,该指令也激发了其他联邦机构的行动。

PMCID

PMCID (PubMed中央标识符),也称为PMC参考编号,是PubMed中央数据库的书目标识符,很像PMID是PubMed数据库的书目标识符。然而,这两个标识符是不同的。它由“PMC”和一个由7个数字组成的字符串组成。格式是: PMCID: PMC1852221

申请NIH奖项的作者必须在他们的申请中包括PMCID。

来源:维基百科

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