ImageJ使用手册翻译 part3-2.1 ImageJDistributions

avatar 2019-05-2215:00:32 评论 155

ImageJ中文教程

ImageJ本身是没有那么强大的:其真正的强大之处在于大量的插件拓展了ImageJ本身的功能。由世界范围内的贡献者们提供的成百甚至上千的免费插件是使得ImageJ能够成功的重要因素。需要注意的是,执行命令Help▷Update ImageJ…并不能更新你已经安装过的插件。

 

ImageJ附件(Plugins, Scripts 以及 Marcos)可以从多种渠道获得(特别是:ImageJ的插件页[Help▷Plugins…], ImageJ 信息和文档门户以及Fiji的网页),这使得手动更新十分艰难。因此,使用提前组织好各类附件的ImageJDistributions就会极其方便。

 

下面是一些与ImageJ最相关的一些工具,可以用来解决一些在组织和维护超过ImageJ基础功能过程中的问题。如果你是一位生命科学家,不知道该选择哪一个模块,那么你应该选择Fiji。Fiji的维护得很好,可提供自动更新、改进的脚本功能并且附带强大的插件。更多有关ImageJ的改编的信息,详见构建在ImageJ上的软件包

 

Fiji

Fiji是ImageJ的一个分块,其连同Java、Java 3D以及一些插件组成一个连贯的菜单结构。用其开发者的话来说就是“Fiji与ImageJ相比,就像Ubuntu对比于Linux”。ImageJ专注于辅助生命科学研究,对图像进行配准、拼合、分割、特征提取以及3D可视化等等。同时它支持多种脚本语言(BeanScript、Clojure、Jython、Python、Ruby, 参考其他语言的脚本)。重要的一点是Fiji自带一个方便的更新器,可以知道你的文件是否是最新的版本、废弃的或是局部修改过的。其对大多数插件都可以获得一份完整的说明。Fiji软件在2008年的用户与开发人员会议上首次对外公开。

 

MBF ImageJ

MBF ImageJ bundle或者说ImageJ for Microscopy (之前交WCIF-ImageJ),突出了一些插件和宏命令,由麦克马斯特大学的Tony Collins 在MacBiophotonics设备上比照和组织完成。这个包(MBF ImageJ bundle)带有一个完整的操作手册,描述了如何使用该包来处理光学显微镜的图片资料/数据。该包对显微镜工作者来说是一个极好的资源,但缺点是维护不太活跃,滞后于主体ImageJ的发展。

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