ImageJ 多维堆栈

Hyperstacks

该子菜单包含于多维堆栈、4维或者5维图片相关的命令。普通的堆栈(stack)命令可在Image▷Stack▷子菜单中查找。

ImageJ多维堆栈Hyperstack对话框


New Hyperstack…

创建一个新的多维堆栈。多维堆栈具有Width、Height、Channels(c 维)、slice(z 维)以及时间Frames(t 维)几个维度。

可以对Image Type (参考Image▷Type▷以及图片类型和格式)和Display Mode(Channels Tool…)进行设定。

勾选Label Images可在多维堆栈的每张图片上显示频道数、切片数以及帧数。


Stack to Hyperstack

ImageJ将堆栈转化为多维堆栈

将堆栈转化为多维堆栈。其中RGB堆栈转化为3个频道的多维堆栈。

  • Oder是指堆栈中的Channels(c)、slices(z)以及frames(t)的顺序。ImageJ的多维堆栈总是czt的 顺序。不是该顺序的堆栈会被重排为czt的顺序。
  • 频道Display Mode可以选择Composite、Color以及Grayscale。

Hyperstack to Stack

将多维堆栈转化为堆栈。


Reduce Dimensionality

ImageJ reduce对话框

该命令通过创建新的多维堆栈对某一个多维堆栈进行降维。比如:将所有频道和时间点放在一个确定的z轴位置或者将所有z切片对应于当前的频道和时间点。

  • 去掉Channels(n)选项可删除除当前频道之外的所有频道;
  • 去掉Slice(n)选项则删除除当前切片之外的所有切片;
  • 去掉Frame(n)选项则删除除当前时间点之外的所有时间点;

预期降维后的堆栈的维度和尺寸会显示在对话框中。


Channels Tool…[Z]

命令用于打开Channels小窗口,或者在其已经打开的状态下将其移动到页面前来,该命令的快捷键是Shift+Z。该工具可以对合成图片的显示模式(Display Mode)进行选择。此外,在Image▷Color▷子菜单下的一些命令在这里也可以通过More>>下拉菜单获得。该下拉菜单还提供了原色列表(加色:红、绿、蓝; 减色:青色、洋红、黄色),可应用于伪彩色的色彩合成图像。

ImageJ频道Channel处理工具对话框

使用Image▷Color▷Channels Tool…对色彩合成图像进行频道处理






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